Báthorit János Zsigmond fejedelem halála után emelték Erdély trónjára 1571. május 25-én, 1575. de­cember 14-én pedig lengyel ki­rállyá választották, 1576. má­­­jus 1-jén koronázták meg Krakkóban. Mindkét trónt 1586. december 12-én bekövetkezett haláláig bírta. Örök álmát a waweli székesegyház krip­tá­­jában alussza, síremléke a szentélykörüljáró keleti szár­­nyában, a Mária-ká­pol­nában ta­lálható. A szé­kesegyház a szinte folyamatos bővítés, átépítés jegyeit viseli magán.

Korábban két román kori templom állt a helyén, pusztulásuk után, 1320-ban kezdték emel­ni rom­jaikon a gótikus temp­lomot, amelyet 1364-ben szen­­teltek fel. A háromhajós, ke­reszthajós bazilikát később kápolnakoszorúval építették kö­rül, valamennyi hozzátoldott építmény építése korának stí­lusjegyeit viseli magán. Ér­dekes módon a stíluskavalkád mégsem hat eklektikusnak, a különböző stílusjegyek ke­ve­re­dése, tobzódása mégis har­móniát sugall. A templomban tizenkilenc lengyel uralkodó sír­ját őrzik, de itt helyezték vég­ső nyughelyre a lengyel kul­túra és történelem más nagyjait is, mint például a három leg­jelentősebbnek tartott lengyel romantikus költő, Adam Mickiewicz, Juliusz Słowacki és Cyprian Kamil Norwid ham­vait, de ide temették 2010-ben a szmolenszki légi ka­tasztrófában elhunyt Lech Kaczyński államfőt és felesé­gét is.